我科肺功能室于1958年建院初始同步建立，为重庆首批呼吸功能室，拥有各类大型肺功能仪、呼出气一氧化氮 (FeNO)检测仪以及心肺运动仪。目前开展肺通气功能、弥散功能、残气功能、气道阻力、支气管舒张试验、支气管激发试验、呼出气一氧化氮测定以及心肺运动试验等检查。肺功能检查团队拥有2名医师、1名副主任护士、3名护师，均有丰富的临床经验，年检查人次2万余，每年接待进修人员30余人。多次举办重庆市肺功能继续教育培训班，是国家PCCM第一批肺功能单修基地。